Een kwaliteitshandboek volgt de structuur van ISO 9001 hoofdstuk 4-10: context van de organisatie, leiderschap en kwaliteitsbeleid, planning (risico's en doelstellingen), ondersteuning (middelen, competenties, documentbeheer), uitvoering (operationele processen), evaluatie (audits, directiebeoordeling) en verbetering (afwijkingen, corrigerende maatregelen).